시스템엔지니어링과 사업관리(project management)는 상호보완적 역할을 통해 개발사업의 성공을 위해 긴밀히 인터페이스 하며 함께 한다. 사업관리가 개발사업의 전체적 구성요소들 즉, 인적시스템, 자원과 예산 등의 입출력 요소들 그리고 일정목표의 관리와 사업목표 달성에 문제가 되는 모든 위험부담 요소들의 식별, 경감/해소관리 등에 대한 책임을 지고 활동 한다면 시스템엔지니어링은 모든 기술적 활동과 관련된 요소들에 대한 목표달성과 위험부담 요소들의 식별, 정의 그리고 경감/해소관리를 위한 활동의 책임을 지고 관련된 기술관리, 통제 및 통합 활동들을 수행한다.

임무시스템엔지니어링을 개발사업에 적용 할 경우, 이질적 복합시스템 구성요소들 중 공정시스템과 지원설비/도구시스템들을 어떻게 도입 및 설계하여 제품시스템 개발을 위한 문제정의와 해결책 정의를 수행하고 구축해 갈 것 인지에 대한 개발공정의 기획과 설계 그리고 관리 활동들을 구체화 하는 업무가 시스템엔지니어링 관리활동 이며 이 업무에 대한 산출물이 시스템엔지니어링계획서(SEP 또는 SEMP)이다.

개발사업에서 두 분야의 역할은 INCOSE 핸드북에서 다음 그림 1.과 같이 비교해 주며 독자적 또는 중복적 활동들이 각각의 역할을 잘 보여 주고 있다. 중복적 활동들은 기술영역과 비기술영역에 대하여 역무의 정의, 위험요소 관리 그리고 고객 또는 이해관계자들과의 모든 상호작용들을 나타낸다.

그림 1. 시스템엔지니어링과 사업관리 비교

결국 개발사업이라는 이질적 복합시스템 전체의 기획과 설계 그리고 자원(인적, 물적)과 일정목표 관리는 사업관리에서 기술적 또는 품질목표에 대한 그리고 관련한 변경관리와 불확실성에 의한 리스크관리는 시스템엔지니어링의 영역으로 구분 할 수가 있다. 2015년 개정된 시스템엔지니어링과 소프트웨어엔지니어링 국제표준인 ISO/IEC 15288 표준은 그림 2.에서 보여 주듯이 개발되는 모든 시스템들의 수명주기 공정들을 네 가지로 나누고 그 중 기술관리 프로세스를 다음과 같은 여덟개로 정의하고 있다.

사업기획; 사업평가와 통제; 의사결정관리; 위험관리; 형상관리; 정보관리; 계측관리; 그리고 품질보증 등의 기술관리 업무들이다. 미 국방부는 이들의 성공적 수행을 위하여 시스템엔지니어링관리계획서를, Systems Engineering Plan(SEP) 또는 Systems Engineering Management Plan(SEMP) 산출물을, 통하여 사업주 편에서 SEP을 작성하고 사업수주자 입장에서는 SEMP를 작성하여 사업을 각각 시작하면서 점차 두 계획서 내용들이 구체화 되면서 내용들을 공유하게 된다.

그림 2. 시스템 생명주기에 걸친 프로세스들 (ISO/IEC 15288)

시스템을 개발하는 모든 기관들이 그림 2.의 네 가지 영역 필수 프로세스에서 성숙도를 얼마나 갖추고 있느냐에 따라 시스템개발 사업들의 성공적 수행능력이 결정되며 특히 그 중 여덟가지 기술관리프로세스와 열네가지 기술프로세스들이 시스템엔지니어링의 핵심 프로세스들이며 이들을 수행하는 방법과 도구들에 대한 내용이 시스템엔지니어링의 학제 분야이다.